Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
BNIP1Q12981 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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BNIP1Q12981 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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BNIP1Q12981 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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BNIP1Q12981 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BNIP1Q12981 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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