Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SMARCB1Q12824 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMARCB1Q12824 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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