Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GTF3C1Q12789 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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GTF3C1Q12789 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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GTF3C1Q12789 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF3C1Q12789 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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