Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PGGT1BP53609 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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PGGT1BP53609 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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PGGT1BP53609 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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PGGT1BP53609 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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PGGT1BP53609 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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PGGT1BP53609 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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PGGT1BP53609 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PGGT1BP53609 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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