Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.02□□□□□ -2.73
CENPFP49454 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-2.02□□□□□ -2.73
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CENPFP49454 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
CENPFP49454 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
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CENPFP49454 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
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CENPFP49454 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
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CENPFP49454 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
CENPFP49454 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
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