Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD10P28358 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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HOXD10P28358 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD10P28358 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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