Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NMBRP28336 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NMBRP28336 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NMBRP28336 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NMBRP28336 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NMBRP28336 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms