Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPRDP23468 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPRDP23468 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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