Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRCP08575 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRCP08575 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms