Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTIFO43310 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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