Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRDMT1O14717 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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TRDMT1O14717 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRDMT1O14717 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRDMT1O14717 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRDMT1O14717 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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