Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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ERVV-2B6SEH9 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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ERVV-2B6SEH9 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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ERVV-2B6SEH9 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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ERVV-2B6SEH9 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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ERVV-2B6SEH9 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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