Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HCN3Q9P1Z3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HCN3Q9P1Z3 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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