Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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USP53Q70EK8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP53Q70EK8 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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USP53Q70EK8 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP53Q70EK8 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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