Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
C9orf135Q5VTT2 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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C9orf135Q5VTT2 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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C9orf135Q5VTT2 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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C9orf135Q5VTT2 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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C9orf135Q5VTT2 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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