Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SFT2D3Q587I9 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms