Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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