Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SGCAQ16586 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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SGCAQ16586 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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SGCAQ16586 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SGCAQ16586 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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