Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SGCBQ16585 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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