Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SCN9AQ15858 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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