Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
USF2Q15853 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
USF2Q15853 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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USF2Q15853 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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USF2Q15853 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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USF2Q15853 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
USF2Q15853 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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USF2Q15853 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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USF2Q15853 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
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USF2Q15853 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
USF2Q15853 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
USF2Q15853 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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