Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SEC23BQ15437 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SEC23BQ15437 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SEC23BQ15437 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SEC23BQ15437 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SEC23BQ15437 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SEC23BQ15437 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
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SEC23BQ15437 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SEC23BQ15437 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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