Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SYCP1Q15431 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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SYCP1Q15431 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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SYCP1Q15431 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
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SYCP1Q15431 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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SYCP1Q15431 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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SYCP1Q15431 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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