Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RAB35Q15286 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB35Q15286 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB35Q15286 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB35Q15286 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB35Q15286 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB35Q15286 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.9 ms