Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SMC1AQ14683 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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