Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GBX1Q14549 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GBX1Q14549 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GBX1Q14549 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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