Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD9Q14511 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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