Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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SCARB2Q14108 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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SCARB2Q14108 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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SCARB2Q14108 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCARB2Q14108 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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