Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PDE6HQ13956 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms