| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.276-201 | ENST00000364732 | 109 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-806P-201 | ENST00000365147 | 105 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU11-3P-201 | ENST00000391111 | 133 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND2P23-201 | ENST00000422990 | 651 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099677.2-201 | ENST00000436385 | 175 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL118496.2-201 | ENST00000448300 | 230 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTATP8P1-201 | ENST00000467115 | 207 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104435.1-201 | ENST00000483483 | 166 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC005786.1-201 | ENST00000588553 | 154 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC091965.1-202 | ENST00000607662 | 397 nt | TSL 3 BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | U6.115-201 | ENST00000636045 | 103 nt | BASIC | 2.05 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AL355796.1-201 | ENST00000406706 | 323 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | MIR4300-201 | ENST00000581016 | 96 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022441.3-201 | ENST00000605737 | 136 nt | BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | ZBTB6-201 | ENST00000373659 | 4106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.04 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HAS2-201 | ENST00000303924 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.162-201 | ENST00000363683 | 102 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-30-201 | ENST00000364117 | 82 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.243-201 | ENST00000364481 | 109 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1310P-201 | ENST00000384153 | 107 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD63-201 | ENST00000384262 | 68 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR504-201 | ENST00000385065 | 83 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA48.3-201 | ENST00000391081 | 134 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL023284.1-201 | ENST00000403956 | 276 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC37P-201 | ENST00000408328 | 131 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-54P-201 | ENST00000410299 | 190 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358234.1-201 | ENST00000421132 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC025465.3-201 | ENST00000510570 | 311 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | MIR5002-201 | ENST00000584713 | 97 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008737.2-201 | ENST00000599446 | 118 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC136443.5-201 | ENST00000603741 | 370 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6840-201 | ENST00000611937 | 71 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U1.36-201 | ENST00000620684 | 176 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF720P1-201 | ENST00000562403 | 1939 nt | BASIC | 2.03 | □□□□□ -2.08 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCN7A-201 | ENST00000409855 | 7183 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD36-208 | ENST00000639751 | 3090 nt | TSL 5 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIRLET7G-201 | ENST00000362280 | 84 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.446-201 | ENST00000384178 | 104 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA67.3-201 | ENST00000384366 | 140 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA48.1-201 | ENST00000390879 | 135 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-46-201 | ENST00000390982 | 71 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA11.4-201 | ENST00000408823 | 129 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL158823.1-201 | ENST00000418441 | 478 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008134.1-201 | ENST00000420943 | 193 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DPH3P2-201 | ENST00000422618 | 250 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4435-2HG-213 | ENST00000451884 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P22-201 | ENST00000458380 | 195 nt | BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMSD-204 | ENST00000526932 | 162 nt | TSL 3 BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MCMDC2-207 | ENST00000492775 | 1831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SYT14-201 | ENST00000367015 | 5094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.02 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005336.3-201 | ENST00000623833 | 2679 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL596028.1-201 | ENST00000326971 | 197 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD81.1-201 | ENST00000363064 | 77 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA20B-201 | ENST00000384220 | 132 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA64-201 | ENST00000384674 | 134 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-30P-201 | ENST00000410245 | 143 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL356379.1-201 | ENST00000414105 | 126 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC035139.1-201 | ENST00000423256 | 273 nt | TSL 3 BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL358176.2-201 | ENST00000425769 | 204 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01399-202 | ENST00000458450 | 244 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-41P-201 | ENST00000516161 | 162 nt | BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |