Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
GTF2H2Q13888 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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