Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HTR4Q13639 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms