Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CUL1Q13616 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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