Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUBB3Q13509 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUBB3Q13509 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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TUBB3Q13509 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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TUBB3Q13509 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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TUBB3Q13509 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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