Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MTM1Q13496 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
MTM1Q13496 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MTM1Q13496 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MTM1Q13496 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
MTM1Q13496 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MTM1Q13496 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms