Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMAD4Q13485 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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