Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
ATMQ13315 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
ATMQ13315 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
ATMQ13315 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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