Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CLN3Q13286 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLN3Q13286 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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