Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SRSF6Q13247 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms