Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NME3Q13232 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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NME3Q13232 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NME3Q13232 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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NME3Q13232 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NME3Q13232 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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