Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PPFIA1Q13136 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PPFIA1Q13136 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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