Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
IFT88Q13099 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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IFT88Q13099 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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