Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL28Q13084 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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