Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
GRIN2AQ12879 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
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GRIN2AQ12879 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
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GRIN2AQ12879 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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GRIN2AQ12879 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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GRIN2AQ12879 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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GRIN2AQ12879 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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