Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CHD3Q12873 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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