Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CPSF1Q10570 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CPSF1Q10570 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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