Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
E2F1Q01094 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F1Q01094 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms