Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRBP23467 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
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PTPRBP23467 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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