Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ERVV-2B6SEH9 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ERVV-2B6SEH9 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms