Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SORCS3Q9UPU3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SORCS3Q9UPU3 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms